Tests génétiques optimisés pour des populations diverses afin de réduire les inégalités de santé






Tests génétiques améliorés évaluent plus précisément le risque de maladie indépendamment de l’ascendance génétique.

Pour empêcher une technologie génomique émergente de contribuer à creuser les inégalités en matière de santé, une équipe scientifique financée par les National Institutes of Health a élaboré de nouvelles façons d’améliorer une méthode de test génétique appelée score de risque polygénique. Étant donné que les scores de risque polygénique n’ont pas été efficaces pour toutes les populations, les chercheurs ont recalibré ces tests génétiques à l’aide de données génomiques diversifiées ancestral. Comme indiqué aujourd’hui (19 février) dans Nature Medicine, les tests optimisés fournissent une évaluation plus précise du risque de maladie dans des populations diverses.

Addressing the Challenge of Ancestral Diversity

Genetic tests look at the small differences between individuals’ genomes, known as genomic variants, and polygenic risk scores are tools for assessing many genomic variants across the genome to determine a person’s risk for disease. As the use of polygenic risk scores grows, one major concern is that the genomic datasets used to calculate the scores often heavily overrepresent people of European ancestry.

Plus précisément, ces participants provenaient de divers horizons ancestraux, démontrant que les scores de risque polygénique recalibrés ne sont pas biaisés en faveur des personnes d’ascendance européenne et sont efficaces pour toutes les populations.

“Notre modèle augmente considérablement la probabilité qu’une personne du groupe à risque élevé obtienne un résultat à haut risque, quelle que soit son ascendance génétique”, a déclaré le Dr Lennon. “La diversité de l’ensemble de données All of Us était cruciale pour notre capacité à faire cela.”

Cependant, ces scores optimisés ne peuvent pas à eux seuls résoudre les disparités en matière de santé. “Les résultats des scores de risque polygénique ne sont utiles que pour les patients qui peuvent agir pour prévenir la maladie ou la détecter tôt, et les personnes ayant un accès moindre aux soins de santé auront également du mal à obtenir les activités de suivi recommandées, telles que des dépistages plus fréquents,” a déclaré le Dr Lennon.

Cependant, ce travail constitue une étape importante vers l’utilisation systématique des scores de risque polygénique dans la clinique pour le bénéfice de toutes les personnes. Les 2 500 participants à cette étude représentent seulement un premier aperçu des scores de risque polygénique améliorés. Le réseau eMERGE des dossiers de santé électronique et génomique des NIH poursuivra cette recherche en inscrivant un total de 25 000 participants issus de populations diversifiées dans la prochaine phase de l’étude.

Référence : “Sélection, optimisation et validation de dix scores de risque polygéniques pour la mise en place clinique dans des populations diverses aux États-Unis” par Niall J. Lennon, Leah C. Kottyan, Christopher Kachulis, Noura S. Abul-Husn, Josh Arias, Gillian Belbin, Jennifer E. Below, Sonja I. Berndt, Wendy K. Chung, James J. Cimino, Ellen Wright Clayton, John J. Connolly, David R. Crosslin, Ozan Dikilitas, Digna R. Velez Edwards, QiPing Feng, Marissa Fisher, Robert R. Freimuth, Tian Ge, The GIANT Consortium, The All of Us Research Program, Joseph T. Glessner, Adam S. Gordon, Candace Patterson, Hakon Hakonarson, Maegan Harden, Margaret Harr, Joel N. Hirschhorn, Clive Hoggart, Li Hsu, Marguerite R. Irvin, Gail P. Jarvik, Elizabeth W. Karlson, Atlas Khan, Amit Khera, Krzysztof Kiryluk, Iftikhar Kullo, Katie Larkin, Nita Limdi, Jodell E. Linder, Ruth J. F. Loos, Yuan Luo, Edyta Malolepsza, Teri A. Manolio, Lisa J. Martin, Li McCarthy, Elizabeth M. McNally, James B. Meigs, Tesfaye B. Mersha, Jonathan D. Mosley, Anjene Musick, Bahram Namjou, Nihal Pai, Lorenzo L. Pesce, Ulrike Peters, Josh F. Peterson, Cynthia A. Prows, Megan J. Puckelwartz, Heidi L. Rehm, Dan M. Roden, Elisabeth A. Rosenthal, Robb Rowley, Konrad Teodor Sawicki, Daniel J. Schaid, Roelof A. J. Smit, Johanna L. Smith, Jordan W. Smoller, Minta Thomas, Hemant Tiwari, Diana M. Toledo, Nataraja Sarma Vaitinadin, David Veenstra, Theresa L. Walunas, Zhe Wang, Wei-Qi Wei, Chunhua Weng, Georgia L. Wiesner, Xianyong Yin and Eimear E. Kenny, 19 février 2024, Nature Medicine.

DOI: 10.1038/s41591-024-02796-z